Az IBM a genetikai olvasás kereskedelmi forgalomba hozatalához

Az IBM együttműködött az orvostechnikai eszközök gyártójával, hogy egy olcsó, emberi genomokat felépítő eszközt építsenek ki, a vállalat csütörtökön bejelentette.

Bár a technológia még mindig egy évtizeddel vagy annál távolabb van a kereskedelmi forgalomtól, ha befejezte, minden orvosnak olcsó és gyors módszert kell adnia Ajay Royyuru, az IBM Research számítástechnikai biológiai vezetője.

"A genom szekvenálásának költsége lecsökkent, és a sebesség elkezdett javulni, de még mindig vannak problémák a sebesség, a skála, áteresztőképességet és költségeket "- mondta Royyuru.

A projekt az IBM" DNS tranzisztorát "fogja használni. Ezek a tranzisztorok tartalmaznak nanopórákat vagy nagyon apró pórusokat, amelyek mindegyikénél dezoxiribonukleinsav (DNS) szálat képesek futtatni. A nanopórus a DNS minden egyes bázisát elektromos mező segítségével azonosítja.

Mivel a nanopórát részben szilíciumból állítják elő, képesnek kell lennie arra, hogy a mikroprocesszorok előállításához használt ugyanazon litográfiás technikákkal tömegesen legyen képes előállítani, Míg más kutatók is felfedezték a nanopórusok használatát, az ilyen minták nem tudják pontosan elolvasni a DNS-t, mert a DNS túl gyorsan halad a póruson keresztül.

"Olyan, mintha a spagettit szopni, elindul a nanopórán át, nagyon gyorsan halad, miután 48 ezer darab DNS-t láttunk 10 vagy 20 milliszekundumban, ebben a sebességben nagyon kevés esélyünk van arra, hogy helyesen olvassuk le. "- mondta Royyuru. az IBM az elektromos vezérléssel a nanopórára állította az áramlást a kívánt sebességre. "A DNS-mozgást elektromosan vezérelhetjük a póruson keresztül, egységenként továbbhaladhatjuk."

Bár a DNS-szekvenálási technológiák az 1970-es évek elejétől kezdve léteztek, az egész emberi genomot nem dekódálták teljes egészében egészen 2001-ig, mivel a nagyszámú bázispár dekódolásához szükséges automatának köszönhető. Minden ember DNS-je körülbelül 3 milliárd bázispáros nukleotidot tartalmaz.

Amíg a DNS-szekvenálási technológia javult azóta, még mindig néhány százezer dollárért költik el egy teljes emberi genomot, mondta Royyuru. Ha készen áll, az eszköznek képesnek kell lennie arra, hogy bárhonnan akár 100 dollárról 1000 dollárra is lehessen olvasni, Royyuru becslése szerint.

Royyuru elutasította, hogy időt adjon a gép kereskedelmi forgalomba hozatalára, idézve a szükséges lépéseket radikálisan új technológiát termel. Becslések szerint körülbelül öt-tíz évet vesz igénybe a kutatás befejezése.

A Roche szekvenciáló leányvállalata, a 454 Life Sciences végül az ebből az együttműködésből származó termékeket fogja értékesíteni. Az IBM az építőiparban és az adatkezelésben szerez tudománnyal a partneri kapcsolatot, míg a Roche az orvosi diagnosztikában és a genomszekvenálásban fogalmazza meg ismereteit. "

Az egyén genetikai kódjának olvasása többféle egészségügyi ellátással járhat, magyarázta Royyuru. Leginkább ez lehetővé teszi az orvosok számára, hogy "személyre szabják az orvosi ellátást" - mondta. Például sok gyógyszer fog működni néhány, de nem minden embernél. Ha egy személy DNS-é kezében van, segíteni fog az orvosnak, hogy felírja a megfelelő gyógyszert. A genom olvasása bizonyos betegségekre való hajlamot is feltárhat.

Talán egy másik korai alkalmazás lehet annak meghatározásában, hogy mennyi ideig élhetnek az egyének. A bostoni egyetem kutatói csütörtökön bejelentették, hogy megtalálják azt, ami a hosszú élettartam genetikai aláírásának tűnik.

Joab Jackson a vállalati szoftvereket és az általános technológiai hírleveleket foglalja össze

Az IDG News Service számára. Kövesse Joabot a Twitteren a @Joab_Jackson-on. Joab e-mail címe [email protected]